Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CDK5Q00535 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CDK5Q00535 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CDK5Q00535 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms