Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
GNB1P62873 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNB1P62873 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNB1P62873 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNB1P62873 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNB1P62873 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNB1P62873 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNB1P62873 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNB1P62873 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNB1P62873 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNB1P62873 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GNB1P62873 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNB1P62873 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNB1P62873 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GNB1P62873 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNB1P62873 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNB1P62873 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNB1P62873 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNB1P62873 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNB1P62873 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNB1P62873 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNB1P62873 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNB1P62873 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNB1P62873 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GNB1P62873 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB1P62873 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB1P62873 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB1P62873 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB1P62873 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB1P62873 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB1P62873 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB1P62873 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB1P62873 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB1P62873 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB1P62873 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB1P62873 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB1P62873 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB1P62873 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB1P62873 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB1P62873 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB1P62873 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB1P62873 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
GNB1P62873 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB1P62873 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB1P62873 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB1P62873 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB1P62873 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB1P62873 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB1P62873 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB1P62873 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB1P62873 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB1P62873 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB1P62873 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB1P62873 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB1P62873 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB1P62873 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB1P62873 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB1P62873 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB1P62873 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB1P62873 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB1P62873 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
GNB1P62873 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNB1P62873 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GNB1P62873 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNB1P62873 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNB1P62873 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNB1P62873 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNB1P62873 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNB1P62873 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNB1P62873 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNB1P62873 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GNB1P62873 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB1P62873 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB1P62873 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB1P62873 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB1P62873 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB1P62873 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB1P62873 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB1P62873 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB1P62873 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB1P62873 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB1P62873 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB1P62873 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB1P62873 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GNB1P62873 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB1P62873 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB1P62873 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB1P62873 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB1P62873 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB1P62873 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB1P62873 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB1P62873 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB1P62873 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB1P62873 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB1P62873 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB1P62873 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB1P62873 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB1P62873 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB1P62873 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GNB1P62873 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms