Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
RAD23AP54725 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms