Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4P48539 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4P48539 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4P48539 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4P48539 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4P48539 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4P48539 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PCP4P48539 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCP4P48539 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCP4P48539 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCP4P48539 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCP4P48539 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCP4P48539 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCP4P48539 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCP4P48539 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCP4P48539 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCP4P48539 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCP4P48539 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCP4P48539 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCP4P48539 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCP4P48539 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCP4P48539 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCP4P48539 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCP4P48539 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCP4P48539 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCP4P48539 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCP4P48539 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PCP4P48539 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCP4P48539 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCP4P48539 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCP4P48539 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCP4P48539 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PCP4P48539 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCP4P48539 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PCP4P48539 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCP4P48539 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCP4P48539 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCP4P48539 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCP4P48539 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCP4P48539 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCP4P48539 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCP4P48539 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCP4P48539 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCP4P48539 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCP4P48539 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCP4P48539 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCP4P48539 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCP4P48539 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCP4P48539 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PCP4P48539 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCP4P48539 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCP4P48539 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCP4P48539 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCP4P48539 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCP4P48539 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCP4P48539 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCP4P48539 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCP4P48539 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCP4P48539 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
PCP4P48539 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCP4P48539 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCP4P48539 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCP4P48539 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCP4P48539 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCP4P48539 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCP4P48539 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCP4P48539 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCP4P48539 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCP4P48539 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCP4P48539 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCP4P48539 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCP4P48539 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCP4P48539 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCP4P48539 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCP4P48539 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCP4P48539 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCP4P48539 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
PCP4P48539 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCP4P48539 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCP4P48539 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCP4P48539 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCP4P48539 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCP4P48539 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
PCP4P48539 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCP4P48539 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCP4P48539 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCP4P48539 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCP4P48539 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCP4P48539 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCP4P48539 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCP4P48539 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCP4P48539 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCP4P48539 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCP4P48539 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCP4P48539 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PCP4P48539 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCP4P48539 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCP4P48539 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCP4P48539 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PCP4P48539 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms