Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ITGAEP38570 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.05
ITGAEP38570 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
ITGAEP38570 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
ITGAEP38570 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms