Protein–RNA interactions for Protein: P35914

HMGCL, Hydroxymethylglutaryl-CoA lyase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGCLP35914 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGCLP35914 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGCLP35914 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HMGCLP35914 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGCLP35914 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGCLP35914 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGCLP35914 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGCLP35914 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGCLP35914 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGCLP35914 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGCLP35914 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGCLP35914 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGCLP35914 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGCLP35914 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HMGCLP35914 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HMGCLP35914 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HMGCLP35914 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMGCLP35914 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGCLP35914 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGCLP35914 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGCLP35914 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGCLP35914 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGCLP35914 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGCLP35914 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGCLP35914 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGCLP35914 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMGCLP35914 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGCLP35914 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMGCLP35914 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms