Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1P21675 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF1P21675 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF1P21675 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF1P21675 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF1P21675 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF1P21675 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TAF1P21675 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TAF1P21675 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TAF1P21675 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TAF1P21675 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TAF1P21675 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TAF1P21675 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TAF1P21675 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TAF1P21675 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAF1P21675 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAF1P21675 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TAF1P21675 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1P21675 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1P21675 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1P21675 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1P21675 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1P21675 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1P21675 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1P21675 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1P21675 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1P21675 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1P21675 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TAF1P21675 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TAF1P21675 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TAF1P21675 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TAF1P21675 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TAF1P21675 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TAF1P21675 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TAF1P21675 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TAF1P21675 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TAF1P21675 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TAF1P21675 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TAF1P21675 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TAF1P21675 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
TAF1P21675 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TAF1P21675 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TAF1P21675 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TAF1P21675 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TAF1P21675 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TAF1P21675 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TAF1P21675 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TAF1P21675 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TAF1P21675 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TAF1P21675 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TAF1P21675 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TAF1P21675 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TAF1P21675 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TAF1P21675 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TAF1P21675 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TAF1P21675 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1P21675 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1P21675 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1P21675 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1P21675 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1P21675 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1P21675 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1P21675 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1P21675 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1P21675 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1P21675 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1P21675 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1P21675 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TAF1P21675 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TAF1P21675 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TAF1P21675 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TAF1P21675 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TAF1P21675 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TAF1P21675 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TAF1P21675 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TAF1P21675 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF1P21675 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF1P21675 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF1P21675 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF1P21675 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF1P21675 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF1P21675 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF1P21675 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF1P21675 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF1P21675 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TAF1P21675 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF1P21675 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF1P21675 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF1P21675 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF1P21675 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF1P21675 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF1P21675 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF1P21675 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF1P21675 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF1P21675 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TAF1P21675 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TAF1P21675 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TAF1P21675 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TAF1P21675 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TAF1P21675 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TAF1P21675 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms