Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APODP05090 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APODP05090 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APODP05090 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APODP05090 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APODP05090 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APODP05090 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
APODP05090 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APODP05090 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APODP05090 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APODP05090 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APODP05090 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APODP05090 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
APODP05090 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APODP05090 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APODP05090 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APODP05090 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APODP05090 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APODP05090 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APODP05090 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
APODP05090 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APODP05090 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
APODP05090 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APODP05090 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APODP05090 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APODP05090 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APODP05090 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APODP05090 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APODP05090 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APODP05090 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APODP05090 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APODP05090 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APODP05090 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APODP05090 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APODP05090 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APODP05090 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APODP05090 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APODP05090 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APODP05090 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APODP05090 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APODP05090 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APODP05090 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APODP05090 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APODP05090 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APODP05090 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APODP05090 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APODP05090 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APODP05090 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APODP05090 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APODP05090 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APODP05090 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APODP05090 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APODP05090 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APODP05090 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APODP05090 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APODP05090 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APODP05090 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APODP05090 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APODP05090 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APODP05090 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APODP05090 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APODP05090 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APODP05090 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APODP05090 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APODP05090 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APODP05090 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APODP05090 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APODP05090 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APODP05090 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APODP05090 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APODP05090 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APODP05090 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APODP05090 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APODP05090 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APODP05090 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APODP05090 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APODP05090 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APODP05090 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APODP05090 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APODP05090 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APODP05090 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APODP05090 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APODP05090 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APODP05090 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APODP05090 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APODP05090 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APODP05090 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APODP05090 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APODP05090 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APODP05090 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APODP05090 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APODP05090 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APODP05090 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APODP05090 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APODP05090 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APODP05090 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APODP05090 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APODP05090 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APODP05090 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APODP05090 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms