Protein–RNA interactions for Protein: O75054

IGSF3, Immunoglobulin superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF3O75054 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGSF3O75054 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
IGSF3O75054 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms