Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRGAP2O75044 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRGAP2O75044 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms