Protein–RNA interactions for Protein: O60664

PLIN3, Perilipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN3O60664 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PLIN3O60664 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PLIN3O60664 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms