Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
LINC01549A6NIU2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.5 ms