Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NOP58Q9Y2X3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NOP58Q9Y2X3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NOP58Q9Y2X3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms