Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LEMD3Q9Y2U8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LEMD3Q9Y2U8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LEMD3Q9Y2U8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.56■■■□□ 2
LEMD3Q9Y2U8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms