Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APPL1Q9UKG1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
APPL1Q9UKG1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
APPL1Q9UKG1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms