Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
RABGEF1Q9UJ41 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
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RABGEF1Q9UJ41 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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RABGEF1Q9UJ41 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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RABGEF1Q9UJ41 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
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RABGEF1Q9UJ41 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
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RABGEF1Q9UJ41 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
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RABGEF1Q9UJ41 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
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RABGEF1Q9UJ41 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
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RABGEF1Q9UJ41 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RABGEF1Q9UJ41 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RABGEF1Q9UJ41 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
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