Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCN11AQ9UI33 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCN11AQ9UI33 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SCN11AQ9UI33 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms