Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CTSFQ9UBX1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTSFQ9UBX1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTSFQ9UBX1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms