Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY33

DPP3, Dipeptidyl peptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPP3Q9NY33 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DPP3Q9NY33 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DPP3Q9NY33 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DPP3Q9NY33 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DPP3Q9NY33 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms