Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATAD3AQ9NVI7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATAD3AQ9NVI7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATAD3AQ9NVI7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms