Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ2

SHCBP1L, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHCBP1LQ9BZQ2 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SHCBP1LQ9BZQ2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHCBP1LQ9BZQ2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHCBP1LQ9BZQ2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms