Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLF1Q9BQI6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SLF1Q9BQI6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLF1Q9BQI6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms