Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRG3Q99928 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GABRG3Q99928 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GABRG3Q99928 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms