Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDNQ99608 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDNQ99608 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDNQ99608 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDNQ99608 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDNQ99608 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDNQ99608 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDNQ99608 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDNQ99608 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDNQ99608 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDNQ99608 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDNQ99608 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDNQ99608 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDNQ99608 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDNQ99608 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDNQ99608 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDNQ99608 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDNQ99608 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDNQ99608 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDNQ99608 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDNQ99608 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDNQ99608 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDNQ99608 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDNQ99608 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NDNQ99608 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDNQ99608 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDNQ99608 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDNQ99608 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDNQ99608 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDNQ99608 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDNQ99608 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDNQ99608 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDNQ99608 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDNQ99608 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NDNQ99608 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NDNQ99608 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDNQ99608 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDNQ99608 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDNQ99608 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDNQ99608 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDNQ99608 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDNQ99608 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDNQ99608 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDNQ99608 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDNQ99608 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDNQ99608 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDNQ99608 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDNQ99608 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDNQ99608 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDNQ99608 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NDNQ99608 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDNQ99608 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDNQ99608 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDNQ99608 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDNQ99608 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDNQ99608 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDNQ99608 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDNQ99608 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDNQ99608 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDNQ99608 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDNQ99608 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDNQ99608 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDNQ99608 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDNQ99608 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDNQ99608 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDNQ99608 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDNQ99608 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDNQ99608 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDNQ99608 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDNQ99608 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDNQ99608 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDNQ99608 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDNQ99608 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDNQ99608 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDNQ99608 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDNQ99608 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDNQ99608 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDNQ99608 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDNQ99608 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDNQ99608 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDNQ99608 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDNQ99608 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDNQ99608 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDNQ99608 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDNQ99608 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDNQ99608 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDNQ99608 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDNQ99608 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDNQ99608 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDNQ99608 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDNQ99608 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDNQ99608 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDNQ99608 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDNQ99608 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDNQ99608 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDNQ99608 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDNQ99608 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDNQ99608 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDNQ99608 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDNQ99608 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms