Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CAPNS2Q96L46 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CAPNS2Q96L46 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPNS2Q96L46 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
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