Protein–RNA interactions for Protein: Q96JX3

SERAC1, Protein SERAC1, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERAC1Q96JX3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SERAC1Q96JX3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SERAC1Q96JX3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SERAC1Q96JX3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms