Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF479Q96JC4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF479Q96JC4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF479Q96JC4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF479Q96JC4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF479Q96JC4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF479Q96JC4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZNF479Q96JC4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF479Q96JC4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF479Q96JC4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF479Q96JC4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF479Q96JC4 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF479Q96JC4 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF479Q96JC4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF479Q96JC4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF479Q96JC4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF479Q96JC4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF479Q96JC4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF479Q96JC4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF479Q96JC4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF479Q96JC4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF479Q96JC4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZNF479Q96JC4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ZNF479Q96JC4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms