Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXNL1Q96CM4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXNL1Q96CM4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXNL1Q96CM4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms