Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CELF1Q92879 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CELF1Q92879 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CELF1Q92879 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms