Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEY7

USP33, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 33, humanhuman

Predictions only

Length 942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP33Q8TEY7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
USP33Q8TEY7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP33Q8TEY7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms