Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAF3

WDR48, WD repeat-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48Q8TAF3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR48Q8TAF3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR48Q8TAF3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR48Q8TAF3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR48Q8TAF3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR48Q8TAF3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR48Q8TAF3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
WDR48Q8TAF3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR48Q8TAF3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR48Q8TAF3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR48Q8TAF3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR48Q8TAF3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR48Q8TAF3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR48Q8TAF3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR48Q8TAF3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR48Q8TAF3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR48Q8TAF3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
WDR48Q8TAF3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR48Q8TAF3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR48Q8TAF3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR48Q8TAF3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR48Q8TAF3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR48Q8TAF3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR48Q8TAF3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR48Q8TAF3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
WDR48Q8TAF3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
WDR48Q8TAF3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
WDR48Q8TAF3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
WDR48Q8TAF3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR48Q8TAF3 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR48Q8TAF3 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR48Q8TAF3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR48Q8TAF3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
WDR48Q8TAF3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms