Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU7

C2CD4A, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD4AQ8NCU7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
C2CD4AQ8NCU7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C2CD4AQ8NCU7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms