Protein–RNA interactions for Protein: Q8N490

PNKD, Probable hydrolase PNKD, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKDQ8N490 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PNKDQ8N490 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PNKDQ8N490 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms