Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
C17orf53Q8N3J3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
C17orf53Q8N3J3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms