Protein–RNA interactions for Protein: Q86YN6

PPARGC1B, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1BQ86YN6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PPARGC1BQ86YN6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PPARGC1BQ86YN6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PPARGC1BQ86YN6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PPARGC1BQ86YN6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PPARGC1BQ86YN6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PPARGC1BQ86YN6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
PPARGC1BQ86YN6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
PPARGC1BQ86YN6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
PPARGC1BQ86YN6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PPARGC1BQ86YN6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
PPARGC1BQ86YN6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms