Protein–RNA interactions for Protein: Q86VL8

SLC47A2, Multidrug and toxin extrusion protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC47A2Q86VL8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC47A2Q86VL8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC47A2Q86VL8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC47A2Q86VL8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC47A2Q86VL8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC47A2Q86VL8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC47A2Q86VL8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC47A2Q86VL8 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC47A2Q86VL8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC47A2Q86VL8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SLC47A2Q86VL8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC47A2Q86VL8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC47A2Q86VL8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC47A2Q86VL8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SLC47A2Q86VL8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC47A2Q86VL8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC47A2Q86VL8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC47A2Q86VL8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC47A2Q86VL8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC47A2Q86VL8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC47A2Q86VL8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC47A2Q86VL8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC47A2Q86VL8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC47A2Q86VL8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC47A2Q86VL8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC47A2Q86VL8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC47A2Q86VL8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC47A2Q86VL8 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC47A2Q86VL8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC47A2Q86VL8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC47A2Q86VL8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC47A2Q86VL8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC47A2Q86VL8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC47A2Q86VL8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC47A2Q86VL8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC47A2Q86VL8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC47A2Q86VL8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC47A2Q86VL8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC47A2Q86VL8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC47A2Q86VL8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC47A2Q86VL8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC47A2Q86VL8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC47A2Q86VL8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC47A2Q86VL8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms