Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BHLHA9Q7RTU4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BHLHA9Q7RTU4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms