Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q5H1

TY1A-PR3, Transposon Ty1-PR3 Gag polyprotein, yeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TY1A-PR3	Q6Q5H1	ASN1	YPR145W	1719 nt		5.74	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	WTM2	YOR229W	1404 nt		5.74	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	IMA3	YIL172C	1770 nt		5.73	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	IMA4	YJL221C	1770 nt		5.73	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PSP2	YML017W	1782 nt		5.73	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	BDP1	YNL039W	1785 nt		5.73	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YDR387C	YDR387C	1668 nt		5.73	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	CLA4	YNL298W	2529 nt		5.73	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	NPY1	YGL067W	1155 nt		5.73	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	GIC1	YHR061C	945 nt		5.73	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PCL7	YIL050W	858 nt		5.73	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	GLG2	YJL137C	1143 nt		5.73	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	GCN3	YKR026C	918 nt		5.73	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	MPP6	YNR024W	561 nt		5.73	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RPL43A	YPR043W	279 nt		5.73	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	TMN2	YDR107C	2019 nt		5.73	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	MDM38	YOL027C	1722 nt		5.73	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YPL247C	YPL247C	1572 nt		5.72	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	SHM1	YBR263W	1473 nt		5.72	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PSA1	YDL055C	1086 nt		5.72	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	DON1	YDR273W	1098 nt		5.72	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	SUF5	tG(CCC)O	72 nt		5.72	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YGR115C	YGR115C	780 nt		5.72	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RPN13	YLR421C	471 nt		5.72	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	OGG1	YML060W	1131 nt		5.72	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	CSI2	YOL007C	1026 nt		5.72	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	NAT3	YPR131C	588 nt		5.72	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	HEM1	YDR232W	1647 nt		5.72	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	URK1	YNR012W	1506 nt		5.72	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	TIM54	YJL054W	1437 nt		5.72	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	UBP7	YIL156W	3216 nt		5.72	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RPN4	YDL020C	1596 nt		5.72	□□□□□ -1.49
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YDR203W	YDR203W	318 nt		5.71	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	SKP1	YDR328C	585 nt		5.71	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	SYF2	YGR129W	648 nt		5.71	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	FOL2	YGR267C	732 nt		5.71	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YJR157W	YJR157W	363 nt		5.71	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	SGT1	YOR057W	1188 nt		5.71	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	DSC3	YOR223W	879 nt		5.71	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	MTC5	YDR128W	3447 nt		5.7	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YIG1	YPL201C	1386 nt		5.7	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	APE1	YKL103C	1545 nt		5.7	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	GPI11	YDR302W	660 nt		5.7	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YDR391C	YDR391C	699 nt		5.7	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	TYW3	YGL050W	822 nt		5.7	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	SCM4	YGR049W	564 nt		5.7	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PTI1	YGR156W	1278 nt		5.7	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YGR210C	YGR210C	1236 nt		5.7	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YIL028W	YIL028W	399 nt		5.7	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	AUR1	YKL004W	1206 nt		5.7	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	SWD2	YKL018W	990 nt		5.7	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	CCW12	YLR110C	402 nt		5.7	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	SAS2	YMR127C	1017 nt		5.7	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YNL108C	YNL108C	813 nt		5.7	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YMD8	YML038C	1329 nt		5.7	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YCR001W	YCR001W	315 nt		5.69	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	COX9	YDL067C	180 nt		5.69	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	UBC1	YDR177W	648 nt		5.69	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YDR415C	YDR415C	1125 nt		5.69	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YGL204C	YGL204C	306 nt		5.69	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PUS6	YGR169C	1215 nt		5.69	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	LIN1	YHR156C	1023 nt		5.69	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YKR032W	YKR032W	315 nt		5.69	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PUP1	YOR157C	786 nt		5.69	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YPL108W	YPL108W	507 nt		5.69	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YPR078C	YPR078C	1119 nt		5.69	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	UBX2	YML013W	1755 nt		5.69	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	MIC60	YKR016W	1623 nt		5.69	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	GCR2	YNL199C	1605 nt		5.69	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	GEX2	YKR106W	1848 nt		5.69	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	ALT1	YLR089C	1779 nt		5.68	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YER156C	YER156C	1017 nt		5.68	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	OST5	YGL226C-A	261 nt		5.68	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RPP1	YHR062C	882 nt		5.68	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	HIS6	YIL020C	786 nt		5.68	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	FUS3	YBL016W	1062 nt		5.68	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YMR030W-A	YMR030W-A	291 nt		5.68	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	AIM36	YMR157C	768 nt		5.68	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	MRPL22	YNL177C	930 nt		5.68	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YNR061C	YNR061C	660 nt		5.68	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	ATG5	YPL149W	885 nt		5.68	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YBR219C	YBR219C	384 nt		5.68	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	SRB6	YBR253W	366 nt		5.68	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PAT1	YCR077C	2391 nt		5.68	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	AFG1	YEL052W	1530 nt		5.68	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YDL109C	YDL109C	1944 nt		5.68	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	MRC1	YCL061C	3291 nt		5.67	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	HXT17	YNR072W	1695 nt		5.67	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YER085C	YER085C	522 nt		5.67	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	ISC10	YER180C	804 nt		5.67	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	CPD1	YGR247W	720 nt		5.67	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	PRS3	YHL011C	963 nt		5.67	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	CBR1	YIL043C	855 nt		5.67	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	MMF1	YIL051C	438 nt		5.67	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	RPR2	YIR015W	435 nt		5.67	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	TEF4	YKL081W	1239 nt		5.67	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	IZH2	YOL002C	954 nt		5.67	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	YNG1	YOR064C	660 nt		5.67	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	KTR7	YIL085C	1554 nt		5.67	□□□□□ -1.5
TY1A-PR3	Q6Q5H1	HOF1	YMR032W	2010 nt		5.67	□□□□□ -1.5

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