Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC62Q6P9F0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC62Q6P9F0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms