Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN8Q6JVE9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LCN8Q6JVE9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LCN8Q6JVE9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms