Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
C9orf135Q5VTT2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
C9orf135Q5VTT2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms