Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRF1Q16656 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRF1Q16656 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRF1Q16656 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRF1Q16656 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRF1Q16656 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRF1Q16656 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRF1Q16656 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRF1Q16656 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRF1Q16656 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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NRF1Q16656 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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NRF1Q16656 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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NRF1Q16656 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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NRF1Q16656 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRF1Q16656 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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NRF1Q16656 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRF1Q16656 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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NRF1Q16656 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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NRF1Q16656 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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NRF1Q16656 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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NRF1Q16656 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NRF1Q16656 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
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NRF1Q16656 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRF1Q16656 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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