Protein–RNA interactions for Protein: Q16385

SSX2, Protein SSX2, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2Q16385 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSX2Q16385 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SSX2Q16385 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SSX2Q16385 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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