Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SNCBQ16143 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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SNCBQ16143 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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SNCBQ16143 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNCBQ16143 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNCBQ16143 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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