Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CDH18Q13634 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CDH18Q13634 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
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