Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIGQ13278 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIGQ13278 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIGQ13278 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIGQ13278 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RIGQ13278 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIGQ13278 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIGQ13278 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIGQ13278 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIGQ13278 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIGQ13278 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIGQ13278 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RIGQ13278 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIGQ13278 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIGQ13278 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RIGQ13278 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIGQ13278 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIGQ13278 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIGQ13278 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIGQ13278 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIGQ13278 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIGQ13278 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RIGQ13278 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIGQ13278 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIGQ13278 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIGQ13278 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIGQ13278 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIGQ13278 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIGQ13278 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIGQ13278 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIGQ13278 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIGQ13278 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIGQ13278 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIGQ13278 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIGQ13278 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RIGQ13278 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIGQ13278 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIGQ13278 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIGQ13278 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIGQ13278 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIGQ13278 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIGQ13278 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIGQ13278 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIGQ13278 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIGQ13278 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIGQ13278 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIGQ13278 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RIGQ13278 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIGQ13278 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIGQ13278 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIGQ13278 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIGQ13278 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIGQ13278 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIGQ13278 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIGQ13278 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIGQ13278 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIGQ13278 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIGQ13278 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIGQ13278 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIGQ13278 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIGQ13278 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIGQ13278 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIGQ13278 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RIGQ13278 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIGQ13278 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIGQ13278 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIGQ13278 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIGQ13278 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIGQ13278 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIGQ13278 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RIGQ13278 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIGQ13278 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIGQ13278 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIGQ13278 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIGQ13278 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RIGQ13278 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RIGQ13278 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIGQ13278 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIGQ13278 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIGQ13278 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIGQ13278 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIGQ13278 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIGQ13278 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIGQ13278 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RIGQ13278 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIGQ13278 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIGQ13278 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RIGQ13278 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIGQ13278 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIGQ13278 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIGQ13278 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIGQ13278 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIGQ13278 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIGQ13278 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIGQ13278 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIGQ13278 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RIGQ13278 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIGQ13278 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIGQ13278 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RIGQ13278 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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