Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTP4A2Q12974 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTP4A2Q12974 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
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