Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
PAX2Q02962 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PAX2Q02962 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms