Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX5P78411 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX5P78411 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX5P78411 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX5P78411 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IRX5P78411 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX5P78411 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX5P78411 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX5P78411 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IRX5P78411 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX5P78411 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX5P78411 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX5P78411 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX5P78411 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX5P78411 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX5P78411 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX5P78411 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX5P78411 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX5P78411 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IRX5P78411 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
IRX5P78411 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IRX5P78411 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IRX5P78411 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX5P78411 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX5P78411 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX5P78411 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX5P78411 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX5P78411 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX5P78411 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX5P78411 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX5P78411 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX5P78411 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX5P78411 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX5P78411 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX5P78411 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX5P78411 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX5P78411 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
IRX5P78411 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX5P78411 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX5P78411 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX5P78411 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX5P78411 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX5P78411 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IRX5P78411 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX5P78411 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX5P78411 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX5P78411 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX5P78411 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX5P78411 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX5P78411 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX5P78411 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX5P78411 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IRX5P78411 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX5P78411 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX5P78411 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX5P78411 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX5P78411 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX5P78411 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX5P78411 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX5P78411 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX5P78411 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX5P78411 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX5P78411 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX5P78411 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IRX5P78411 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX5P78411 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX5P78411 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX5P78411 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX5P78411 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX5P78411 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX5P78411 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX5P78411 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX5P78411 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX5P78411 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX5P78411 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX5P78411 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX5P78411 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX5P78411 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IRX5P78411 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRX5P78411 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
IRX5P78411 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRX5P78411 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRX5P78411 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRX5P78411 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRX5P78411 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IRX5P78411 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRX5P78411 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRX5P78411 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRX5P78411 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRX5P78411 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRX5P78411 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
IRX5P78411 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
IRX5P78411 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IRX5P78411 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IRX5P78411 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRX5P78411 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRX5P78411 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRX5P78411 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRX5P78411 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IRX5P78411 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms