Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
RAD23AP54725 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
RAD23AP54725 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RAD23AP54725 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.5 ms